KinSwingR

DOI:10.18129 / B9.bioc.KinSwingR

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅KinSwingR。

KinSwingR:基于网络的激酶活性预测

Bioconductor版本:3.9

质谱仪KinSwingR phosphosite集成数据来源于数据和kinase-substrate预测预测激酶活性。几个函数允许用户建立PWM kinase-subtrates模型,统计推断PWM:基质匹配,并整合这些数据来推断激酶活性。

作者:阿什利·j·Waardenberg (aut (cre)

维护人员:阿什利·j . Waardenberg <。在gmail.com waardenberg >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“KinSwingR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“KinSwingR”)

HTML	R脚本	KinSwingR
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	网络,蛋白质组学,SequenceMatching,软件
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.5)
进口	data.table,BiocParallel,sqldf、统计数据、网格grDevices
链接
建议	knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	KinSwingR_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	KinSwingR_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	KinSwingR_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/KinSwingR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ KinSwingR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/KinSwingR/
包下载报告	下载数据