inpas
doi：10.18129/b9.bioc.inpas
该包适用于生物导体的3.9版；对于稳定的最新版本，请参阅inpas。
INPAS：用于使用RNA-Seq数据鉴定新型替代聚腺苷酸化位点（PAS）的生物通用套件
生物导体版本：3.9
替代聚腺苷酸化（APA）是大多数人基因中发生的重要转录后调节机制之一。INPA促进了新型APA站点的发现和RNA-Seq数据中APA位点的差异使用。它利用清理dtseq通过删除由于内部涂抹而删除错误站点来微调APA站点。
作者：Jianhong OU，Sungmi M. Park，Michael R. Green和Lihua Julie Zhu
维护者：jianhong ou
引用（从r内，输入引用（“ INPA”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ inpas”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ inpas”）
| html | R脚本 | INPAS小插图 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 替代方案，，，，覆盖范围，，，，差速器，，，，结肠管制，，，，免疫学，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件，，，，转录 |
| 版本 | 1.16.3 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.1（R-3.2）（4。5年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | r（> = 3.1），方法，生物酶，，，，基因组机，，，，GenomicFeatures，，，，S4VECTORS |
| 进口 | AnnotationDbi，，，，BSGENOME，，，，清理，，，，GVIZ，，，，seqinr，，，，预处理，，，，iranges，，，，GenomeInfodB，，，，DEPMIXS4，，，，林玛，，，，生物比较 |
| 链接 | |
| 建议 | 运行，，，，生物基因，，，，生物使用，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10，，，，org.hs.eg.db，，，，org.mm.eg.db，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，txdb.mmusculus.ucsc.mm10.nowngene，，，，rtracklayer，，，，尼特 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | inpas_1.16.3.tar.gz |
| Windows二进制 | inpas_1.16.3.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | inpas_1.16.3.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/inpas |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/inpas |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/inpas/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
