该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅IVAS。
生物导体版本:3.9
鉴定影响替代剪接的遗传变异。
作者:Seonggyun Han,Sangsoo Kim
维护者:Seonggyun Han
引用(从r内,输入引用(“ ivas”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ ivas”)
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要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Ivas”)
R脚本 | IVA:鉴定影响替代剪接的遗传变异 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 替代方案,,,,差异性,,,,差速器,,,,基因表达,,,,结肠管制,,,,免疫学,,,,rnaseq,,,,回归,,,,SNP,,,,测序,,,,软件,,,,转录 |
版本 | 2.4.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.1(R-3.2)(4。5年) |
执照 | GPL-2 |
要看 | R(> 3.0.0),GenomicFeatures,,,,GGPLOT2,,,,生物酶 |
进口 | 多帕尔,,,,LME4,,,,生物基因,,,,基因组机,,,,iranges,,,,foreach,,,,AnnotationDbi,,,,S4VECTORS,,,,GenomeInfodB,,,,Ggfortify,grdevices,方法,矩阵,,,,生物比较,utils,统计 |
链接 | |
建议 | 生物使用 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | IMAS |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | ivas_2.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | ivas_2.4.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | ivas_2.4.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ivas |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/ivas |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/ivas/ |
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