检查

DOI:10.18129 / B9.bioc.INSPEcT

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅检查。

分析4 su-seq RNA-seq时间进程的数据

Bioconductor版本:3.9

检查(推理合成、加工、降解率从转录组数据)RNA-seq时间进程中的数据或不同的实验条件下,有或没有新生的RNA的支持数据。

作者:斯特凡诺德Pretis

维护人员:斯特凡诺德Pretis < ste.depo gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“检查”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“检查”)

PDF	R脚本	检查
PDF	R脚本	RNAdynamics
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文本		新闻

细节

biocViews	GeneRegulation,RNASeq,测序,软件,SystemsBiology,TimeCourse
版本	1.14.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (r - 3.2)(4年)
许可证	GPL-2
取决于	R(> = 3.2),方法,Biobase,BiocParallel
进口	pROC,deSolve,rootSolve编译器,preprocessCore,GenomicFeatures,GenomicRanges,IRanges,BiocGenerics,GenomicAlignments,Rsamtools,S4Vectors,DESeq2,plgem,SummarizedExperiment,TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene,闪亮的
链接
建议	BiocStyle,knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	INSPEcT_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	INSPEcT_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	INSPEcT_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/INSPEcT
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/检查
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/INSPEcT/
包下载报告	下载数据