Harshlight

DOI:10.18129 / B9.bioc.Harshlight

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见Harshlight．

一种微阵列芯片的“校正化妆”程序

Bioconductor版本:3.9

该包用于检测微阵列芯片上的扩展，扩散和紧凑的瑕疵。Harshlight自动标记芯片集合中的区域(affybatch对象)，并返回更正后的affybatch对象，其中有缺陷的区域用NAs或集合中其他芯片中相同探针值的中值代替。新版本将代入值作为整个矩阵处理，解决了内存问题。

作者:Mayte Suarez-Farinas, Maurizio Pellegrino, Knut M. Wittkowski, Marcelo O. Magnasco

维护者:Maurizio Pellegrino

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("Harshlight")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“Harshlight”)

PDF	R脚本	Harshlight
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列，OneChannel，预处理，质量控制，ReportWriting，软件
版本	1.56.0
在Bioconductor	BioC 1.9 (R-2.4)(13年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 2.10)
进口	affy，altcdfenvs，Biobase，统计，效用
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	http://asterion.rockefeller.edu/Harshlight/
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	Harshlight_1.56.0.tar.gz
Windows二进制	Harshlight_1.56.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	Harshlight_1.56.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Harshlight
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Harshlight
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Harshlight/
软件包下载报告	下载数据