GenomicTuples

DOI:10.18129 / B9.bioc.GenomicTuples

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GenomicTuples。

表示和操纵基因元组

Bioconductor版本:3.9

GenomicTuples定义通用容器来存储基因组元组。它的目标是提供功能基因组的元组坐标,类似于那些用于基因组范围的GenomicRanges Bioconductor包。

作者:彼得希<彼得。希在gmail.com >,with contributions from Marcin Cieslik and Hervé Pagès.

维修工:彼得希<彼得。希在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GenomicTuples”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GenomicTuples”)

HTML	R脚本	GenomicTuplesIntroduction
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataRepresentation,基础设施,测序,软件
版本	1.18.1
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.3.0),GenomicRanges(> = 1.31.8),GenomeInfoDb(> = 1.15.2),S4Vectors(> = 0.17.25)
进口	方法,BiocGenerics(> = 0.21.2),Rcpp(> = 0.11.2),IRanges(> = 2.13.13),data.table,stats4
链接	Rcpp
建议	testthat,knitr,BiocStyle,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	www.github.com/PeteHaitch/GenomicTuples
BugReports	https://github.com/PeteHaitch/GenomicTuples/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	GenomicTuples_1.18.1.tar.gz
Windows二进制	GenomicTuples_1.18.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	GenomicTuples_1.18.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GenomicTuples
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GenomicTuples
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GenomicTuples/
包下载报告	下载数据