GeneBreak

DOI:10.18129 / B9.bioc.GeneBreak

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GeneBreak。

打破基因检测

Bioconductor版本:3.9

复发性断点基因检测拷贝数差谱。

作者:翻转van den Broek,燕姿范Lieshout

维护人员:翻转van den Broek < vandenbroek。翻转gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GeneBreak”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GeneBreak”)

PDF	R脚本	GeneBreak
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CopyNumberVariation,DNASeq,遗传学,测序,软件,可视化,WholeGenome,aCGH
版本	1.14.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (r - 3.2)(4年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.2),QDNAseq,CGHcall,CGHbase,GenomicRanges
进口	图形、方法
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/stefvanlieshout/GeneBreak
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	GeneBreak_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	GeneBreak_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	GeneBreak_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GeneBreak
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GeneBreak
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GeneBreak/
包下载报告	下载数据