Genvisr

doi：10.18129/b9.bioc.genvisr

该包适用于生物导体的3.9版；对于稳定的最新版本，请参阅Genvisr。

r中的基因组可视化

生物导体版本：3.9

为基因组数据生成高度可定制的出版物质量图形，主要是在队列级别。

作者：Zachary Skidmore [AUT，CRE]，Alex Wagner [AUT]，Robert Lesurf [aut]，Katie Campbell [aut]，Jason Kunisaki [aut]，Obi Griffith [aut]，Malachi Griffith [AUT]

维护者：Zachary Skidmore

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ genvisr”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ genvisr”）

html	R脚本	genvisr：简介
html	R脚本	可视化小变体
html	R脚本	瀑布：功能简介
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	分类，，，，dnaseq，，，，datarepresentation，，，，基础设施，，，，软件
版本	1.16.1
在生物导体中	Bioc 3.3（R-3.3）（3。5年）
执照	GPL-3 +文件许可证
要看	r（> = 3.3.0），方法
进口	AnnotationDbi，，，，Biomart，，，，生物基因，，，，生物弦，，，，DBI，，，，Ffield，，，，GenomicFeatures，，，，基因组机（> = 1.25.4），GGPLOT2（> = 2.1.0），网格，栅格（> = 2.0.0），gtable，，，，gtools，，，，iranges（> = 2.7.5），plyr（> = 1.8.3），RESHAPE2，，，，rsamtools，，，，秤，统计，utils，维里迪斯，，，，Data.Table，，，，BSGENOME，grdevices，GenomeInfodB，，，，变体
链接
建议	生物使用，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，尼特，，，，rmysql，，，，roxygen2，，，，测试，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，rmarkDown，，，，VDIFFR，，，，格式，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38
系统要求
增强
URL
BugReports	https://github.com/griffithlab/genvisr/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	genvisr_1.16.1.tar.gz
Windows二进制	genvisr_1.16.1.zip
Mac OS X 10.11（El Capitan）	genvisr_1.16.1.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genvisr
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/genvisr
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/genvisr/
软件包下载报告	下载统计