这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见GOSim.
Bioconductor版本:3.9
这个包实现了几个有用的函数,用于计算基于GO注释的GO术语和基因产物之间的相似性。此外,它还允许计算氧化石墨烯富集分析
作者:Holger Froehlich
维护者:Holger Froehlich
引文(从R内,输入引用(“GOSim”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GOSim")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“GOSim”)
R脚本 | GOsim | |
参考手册 |
biocViews | 聚类,去,通路,软件 |
版本 | 1.22.0 |
在Bioconductor | BioC 2.13 (R-3.0)(6年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | GO.db,注释 |
进口 | org.Hs.eg.db,AnnotationDbi,topGO,集群,flexmix,RBGL,图,矩阵,corpcor,Rcpp |
链接 | Rcpp |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | igraph |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | GOSim_1.22.0.tar.gz |
Windows二进制 | GOSim_1.22.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | GOSim_1.22.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GOSim |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GOSim |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GOSim/ |
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