GGTools.

DOI：10.18129 / b9.bioc.ggtools.

此套餐适用于Biocumonds 3.9版;对于稳定的最新版本版本，请参阅GGTools.。

基因表达遗传学中分析的软件和数据

生物导体版本：3.9

基因表达和/或DNA甲基化遗传学中分析的软件和数据

作者：vj carey

维护者：vj carey

安装

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if（！perceneNamespace（“biocmanager”，静静= true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“ggtools”）

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文件

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PDF.	r script.	GGTools：EQTL识别软件
PDF.		参考手册
文本		自述
文本		消息

细节

Biocviews.	基因表达那遗传性那遗传学那SNP.那软件
版本	5.20.0
在生物导体中以来	BIOC 1.9（R-2.4）（13岁）
执照	艺术-2.0
依靠	r（> = 2.14），GGBase.（> = 3.19.7），data.table.， 平行，homo.sapiens.
进口	方法，Utils，统计数据，生物根系（> = 0.25.1），Snpstats.那FF.那RSAMTOOLS.那annotationdbi.那BioBase.那少量那VariantAnnotation.那六己那rtracklayer.那GVIZ.，统计数据4，S4Vectors.（> = 0.9.25），绞喉那Genomeinfodb.那Genomicranges.（> = 1.29.6），迭代器那生物仪器那r那big那ggplot2.那重塑2.
链接到
建议	ggdata.那illiminahumanv1.db.那snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37.那Multtest.那AOD.那reta.
系统要求
加强	matrixeqtl.那Foreach.那多达齐全那Gwascat
URL.
取决于我	Ceu1kg.那EQTL.
进口我	CEUHM3.那GenegeneInter
建议我	cgdv17.那DSQTL.那GGBase.那gqtlbase.那HMYRIB36.
链接给我
建立报告

包档案包

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源包	ggtools_5.20.0.tar.gz.
Windows二进制文件	ggtools_5.20.0.zip.
Mac OS x 10.11（El Capitan）	ggtools_5.20.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/ggtools.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ ggtools
包短网址	https://biocumon.org/packages/ggtools/
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