这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GA4GHshiny。
Bioconductor版本:3.9
GA4GHshiny包提供了一种简便的方法与数据服务器进行交互基于基因组学和全球联盟健康(GA4GH)基因组学API通过一个闪亮的应用程序。它还集成了信标网络。
作者:Welliton Souza (aut (cre) Benilton卡瓦略(施),克莉斯婷罗查[所有],伊丽莎白Borgognoni(施)
维护人员:Welliton Souza < well309 gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“GA4GHshiny”)
):
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GA4GHshiny”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“GA4GHshiny”)
HTML | R脚本 | GA4GHshiny |
参考手册 |
biocViews | GUI,软件 |
版本 | 1.6.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.6 (r - 3.4)(2年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | GA4GHclient |
进口 | AnnotationDbi,BiocGenerics,dplyr,DT,GenomeInfoDb,openxlsx,GenomicFeatures、方法、purrr,S4Vectors,闪亮的,shinyjs,tidyr,shinythemes |
链接 | |
建议 | BiocStyle,org.Hs.eg.db,knitr,rmarkdown,testthat,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/labbcb/GA4GHshiny |
BugReports | https://github.com/labbcb/GA4GHshiny/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | GA4GHshiny_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | GA4GHshiny_1.6.0.zip |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | GA4GHshiny_1.6.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GA4GHshiny |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GA4GHshiny |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GA4GHshiny/ |
包下载报告 | 下载数据 |