该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅ga4ghclient。
生物导体版本:3.9
GA4GHCLIENT提供了一种通过全球基因组学和健康联盟(GA4GH)基因组学API访问公共数据服务器的简便方法。它提供对GA4GH API的低级访问权限,并将响应数据转化为基于生物的类对象。
作者:Welliton Souza [AUT,CRE],Benilton Carvalho [CTB],Cristiane Rocha [CTB]
维护者:welliton souza
引用(从r内,输入引用(“ ga4ghclient”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ ga4ghclient”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ ga4ghclient”)
html | R脚本 | ga4ghclient |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | datarepresentation,,,,软件,,,,第三派对人 |
版本 | 1.8.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.5(R-3.4)(2。5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | S4VECTORS |
进口 | 生物基因,,,,生物弦,,,,dplyr,,,,GenomeInfodB,,,,基因组机,,,,httr,,,,iranges,,,,jsonlite, 方法,变体 |
链接 | |
建议 | AnnotationDbi,,,,生物使用,,,,DT,,,,尼特,,,,org.hs.eg.db,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/labbcb/ga4ghclient |
BugReports | https://github.com/labbcb/ga4ghclient/issues |
取决于我 | ga4ghshiny |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | ga4ghclient_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | ga4ghclient_1.8.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | ga4ghclient_1.8.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ga4ghclient |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/ga4ghclient |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/ga4ghclient/ |
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