ga4ghclient

doi:10.18129/b9.bioc.ga4ghclient

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅ga4ghclient

用于访问GA4GH API数据服务器的生物通用套件

生物导体版本:3.9

GA4GHCLIENT提供了一种通过全球基因组学和健康联盟(GA4GH)基因组学API访问公共数据服务器的简便方法。它提供对GA4GH API的低级访问权限,并将响应数据转化为基于生物的类对象。

作者:Welliton Souza [AUT,CRE],Benilton Carvalho [CTB],Cristiane Rocha [CTB]

维护者:welliton souza

引用(从r内,输入引用(“ ga4ghclient”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ ga4ghclient”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ ga4ghclient”)

html R脚本 ga4ghclient
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 datarepresentation,,,,软件,,,,第三派对人
版本 1.8.0
在生物导体中 Bioc 3.5(R-3.4)(2。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 S4VECTORS
进口 生物基因,,,,生物弦,,,,dplyr,,,,GenomeInfodB,,,,基因组机,,,,httr,,,,iranges,,,,jsonlite, 方法,变体
链接
建议 AnnotationDbi,,,,生物使用,,,,DT,,,,尼特,,,,org.hs.eg.db,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
增强
URL https://github.com/labbcb/ga4ghclient
BugReports https://github.com/labbcb/ga4ghclient/issues
取决于我 ga4ghshiny
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 ga4ghclient_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 ga4ghclient_1.8.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) ga4ghclient_1.8.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ga4ghclient
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/ga4ghclient
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/ga4ghclient/
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