funcisnp

doi：10.18129/b9.bioc.funcisnp

该包适用于生物导体的3.9版；对于稳定的最新版本，请参阅funcisnp。

将功能性非编码数据集与遗传关联研究集成，以识别候选调节性SNP

生物导体版本：3.9

FunCISNP集成了来自GWAS，1000基因组和染色质特征的信息，以识别编码或非编码区域中的功能SNP。

作者：Simoncoetzee.com>的Simon G. Coetzee

维护人员：SimonG.Coetzee Simon>

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ funcisnp”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ funcisnp”）

PDF	R脚本	funcisnp小插图
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	注解，，，，DataImport，，，，datarepresentation，，，，基础设施，，，，测序，，，，软件
版本	1.28.0
在生物导体中	Bioc 2.11（R-2.15）（7年）
执照	GPL-3
要看	r（> = 2.14.0），GGPLOT2，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，funcisnp.data
进口	方法，生物基因，，，，生物酶，，，，S4VECTORS，，，，iranges，，，，基因组机，，，，rsamtools（> = 1.6.1），rtracklayer（> = 1.14.1），Chippeakanno（> = 2.2.0），变体，，，，plyr，，，，snpstats，，，，GGPLOT2（> = 0.9.0），重塑（> = 0.8.4），秤
链接
建议	org.hs.eg.db
系统要求
增强	平行
URL	http://coetzeeseq.usc.edu/publication/coetzee_sg_et_al_2012/
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	funcisnp_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	funcisnp_1.28.0.zip
Mac OS X 10.11（El Capitan）	funcisnp_1.28.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/funcisnp
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/funcisnp
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/funcisnp/
软件包下载报告	下载统计