funcisnp
doi：10.18129/b9.bioc.funcisnp
该包适用于生物导体的3.9版；对于稳定的最新版本，请参阅funcisnp。
将功能性非编码数据集与遗传关联研究集成，以识别候选调节性SNP
生物导体版本：3.9
FunCISNP集成了来自GWAS，1000基因组和染色质特征的信息，以识别编码或非编码区域中的功能SNP。
作者：Simoncoetzee.com>的Simon G. Coetzee
维护人员：SimonG.Coetzee
引用（从r内，输入引用（“ funcisnp”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ funcisnp”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ funcisnp”）
| R脚本 | funcisnp小插图 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 注解，，，，DataImport，，，，datarepresentation，，，，基础设施，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.28.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.11（R-2.15）（7年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | r（> = 2.14.0），GGPLOT2，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，funcisnp.data |
| 进口 | 方法，生物基因，，，，生物酶，，，，S4VECTORS，，，，iranges，，，，基因组机，，，，rsamtools（> = 1.6.1），rtracklayer（> = 1.14.1），Chippeakanno（> = 2.2.0），变体，，，，plyr，，，，snpstats，，，，GGPLOT2（> = 0.9.0），重塑（> = 0.8.4），秤 |
| 链接 | |
| 建议 | org.hs.eg.db |
| 系统要求 | |
| 增强 | 平行 |
| URL | http://coetzeeseq.usc.edu/publication/coetzee_sg_et_al_2012/ |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | funcisnp_1.28.0.tar.gz |
| Windows二进制 | funcisnp_1.28.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | funcisnp_1.28.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/funcisnp |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/funcisnp |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/funcisnp/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
