这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见小伙子.
Bioconductor版本:3.9
利用KEGG词条丰富代谢组学数据。给定一组受影响的化合物,FELLA使用知识模型网络中的标签传播建议受影响的反应、酶、模块和途径。生成的子网可以可视化和导出。
作者:Sergio Picart-Armada [aut, cre], Francesc Fernandez-Albert [aut], Alexandre Perera-Lluna [aut]
维护者:Sergio Picart-Armada
引文(从R内,输入引用(“小伙子”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("FELLA")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“小伙子”)
R脚本 | 例如:小家鼠脂肪肝研究 | |
R脚本 | 例子:金头鲷中的氧苯酮暴露 | |
R脚本 | 小伙子 | |
超文本标记语言 | R脚本 | 快速启动 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 去,GraphAndNetwork,KEGG,代谢组学,网络,NetworkEnrichment,通路,软件 |
版本 | 1.4.1 |
在Bioconductor | BioC 3.7 (R-3.5)(1.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.5.0) |
进口 | 方法,igraph,矩阵,KEGGREST,plyr,统计,图形,utils |
链接 | |
建议 | 闪亮的,DT,magrittr,visNetwork,knitr,BiocStyle,rmarkdown,testthat,biomaRt,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,AnnotationDbi,GOSemSim |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | FELLA_1.4.1.tar.gz |
Windows二进制 | FELLA_1.4.1.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | FELLA_1.4.1.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FELLA |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/FELLA |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/FELLA/ |
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