小伙子

DOI:10.18129 / B9.bioc.FELLA

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见小伙子

代谢组学数据的解释和丰富

Bioconductor版本:3.9

利用KEGG词条丰富代谢组学数据。给定一组受影响的化合物,FELLA使用知识模型网络中的标签传播建议受影响的反应、酶、模块和途径。生成的子网可以可视化和导出。

作者:Sergio Picart-Armada [aut, cre], Francesc Fernandez-Albert [aut], Alexandre Perera-Lluna [aut]

维护者:Sergio Picart-Armada

引文(从R内,输入引用(“小伙子”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("FELLA")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“小伙子”)

PDF R脚本 例如:小家鼠脂肪肝研究
PDF R脚本 例子:金头鲷中的氧苯酮暴露
PDF R脚本 小伙子
超文本标记语言 R脚本 快速启动
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文本 新闻

细节

biocViews GraphAndNetworkKEGG代谢组学网络NetworkEnrichment通路软件
版本 1.4.1
在Bioconductor BioC 3.7 (R-3.5)(1.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 3.5.0)
进口 方法,igraph矩阵KEGGRESTplyr,统计,图形,utils
链接
建议 闪亮的DTmagrittrvisNetworkknitrBiocStylermarkdowntestthatbiomaRtorg.Hs.eg.dborg.Mm.eg.dbAnnotationDbiGOSemSim
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 FELLA_1.4.1.tar.gz
Windows二进制 FELLA_1.4.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) FELLA_1.4.1.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FELLA
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/FELLA
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/FELLA/
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