EnrichedHeatmap

DOI:10.18129 / B9.bioc.EnrichedHeatmap

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见EnrichedHeatmap．

制作丰富的热图

Bioconductor版本:3.9

富集热图是一种特殊类型的热图，它可以可视化地显示特定目标区域上基因组信号的富集。这里我们通过ComplexHeatmap包实现了丰富的热图。由于这种类型的热图只是一个普通的热图，但有一些特殊的设置，使用ComplexHeatmap的功能，自定义热图以及连接到热图列表以显示不同数据源之间的对应关系会容易得多。

作者:顾祖光

维护者:祖光谷

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“EnrichedHeatmap”)

超文本标记语言	R脚本	1.制作丰富的热图
超文本标记语言	R脚本	2.可视化分类信号
超文本标记语言	R脚本	3.比较行排序方法
超文本标记语言	R脚本	4.在路线图数据集中可视化综合关联
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	报道，GenomeAnnotation，测序，软件，可视化
版本	1.14.0
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(4年)
许可证	MIT +文件许可
取决于	R(>= 3.1.2)，方法，网格，ComplexHeatmap(> = 1.99.0),GenomicRanges
进口	matrixStats统计数据,GetoptLong，Rcpp跑龙套,locfit，circlize(> = 0.4.5),IRanges
链接	Rcpp
建议	testthat(> = 0.3),knitr，减价，genefilter，RColorBrewer
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/jokergoo/EnrichedHeatmap
全靠我
进口我	profileplyr
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	EnrichedHeatmap_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	EnrichedHeatmap_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	EnrichedHeatmap_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EnrichedHeatmap
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/EnrichedHeatmap
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/EnrichedHeatmap/
软件包下载报告	下载数据