肘
DOI:10.18129 / B9.bioc.ELBOW
这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅肘。
手肘——评估褶皱变化分对数的方式
Bioconductor版本:3.9
手肘一种改进的褶皱变化测试,使用聚类分析和模式识别设置切断限制直接来自intrareplicate没有假定正态分布方差只有2生物复制。肘部也提供了跨平台的一致性一样折叠测试分析。肘部的假阳性和假阴性率低于标准折叠测试时都是评估使用T测试和统计分析微阵列使用12复制(六个复制每一个初始的和最终的条件)。肘部提供了一个null值基于初始条件复制并给出结果的误差范围,允许更好的评价意义。
作者:张祥立,娜塔莉·比约克隆德,格雷厄姆•Alvare汤姆Ryzdak,布莱恩Fristensky理查德•胡瓜鱼
维护人员:格雷厄姆Alvare < Alvare cc.umanitoba。ca >,祥立张< justinzhang。xl gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“肘部”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“肘部”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“肘部”)
| R脚本 | 用手肘——的手肘教程 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | GeneExpression,ImmunoOncology,微阵列,多通道,OneChannel,RNASeq,测序,软件,技术,TwoChannel |
| 版本 | 1.20.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.14 (r - 3.1)(5.5年) |
| 许可证 | 文件许可 |
| 取决于 | R (> = 2.15.0) |
| 进口 | 图形、统计、跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | DESeq,GEOquery,limma,simpleaffy,affyPLM,RColorBrewer,hgu133plus2cdf,hgu133plus2probe |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | ELBOW_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | ELBOW_1.20.0.zip(64位) |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | ELBOW_1.20.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ELBOW |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/手肘 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ELBOW/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
