差异
doi：10.18129/b9.bioc.diffbind
该包适用于生物导体的3.9版；对于稳定的最新版本，请参阅差异。
CHIP-SEQ峰数据的差异结合分析
生物导体版本：3.9
使用亲和力（定量）数据从多个CHIP-SEQ实验中计算差异结合的位点。还可以实现占用（重叠）分析和绘制功能。
作者：Rory Stark
维护者：Rory Stark
引用（从r内，输入引用（“差异”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ diffbind”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ diffbind”）
| R脚本 | 差异：CHIP-SEQ峰数据的差异结合分析 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | chipseq，，，，差异词，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 2.12.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.9（R-2.14）（8年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | r（> = 3.5），基因组机，，，，总结性特征 |
| 进口 | rcolorbrewer，，，，一张地图，，，，EDGER，，，，GPLOTS，grdevices，林玛，，，，基因组签名，，，，Locfit，统计，utils，iranges，，，，格子，，，，Systempiper， 工具，RCPP，，，，dplyr，，，，GGPLOT2，，，，生物比较， 平行，S4VECTORS，，，，rsamtools（> = 1.99.1），deseq2，方法，图形，Ggrepel |
| 链接 | Rhtslib（> = 1.15.3），RCPP |
| 建议 | deseq，，，，生物使用，，，，测试 |
| 系统要求 | |
| 增强 | RGL，，，，XLCONNECT |
| URL | |
| 取决于我 | chipqc，，，，瓦肯 |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | diffbind_2.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | diffbind_2.12.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | diffbind_2.12.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/diffbind |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/diffbind |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/diffbind/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
