延迟

doi:10.18129/b9.bioc.delayedarray

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅延迟

一个统一的框架,用于使用磁盘和内存阵列的数据集透明地工作

生物导体版本:3.9

将类似数组的对象(通常是盘中对象)包装在延迟的对象中,可以在不加载内存中加载对象的情况下对其执行公共数组操作。为了减少内存使用情况并优化性能,对象上的操作要么使用块处理机制延迟或执行。请注意,这也可用于类似内存数组的对象,例如DataFrame对象(通常带有RLE列),矩阵对象以及普通数组和数据框架。

作者:fredhutch.org>的hervépagès peter hickey >

维护者:fredhutch.org上的hervépagès

引用(从r内,输入引用(“延迟”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ delayeredArray”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ delayedarray”)

html 实施延迟的后端
PDF R脚本 在R中使用大型阵列
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 注解,,,,datarepresentation,,,,基因数,,,,基础设施,,,,软件
版本 0.10.0
在生物导体中 Bioc 3.5(R-3.4)(2。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.4),方法,stats4,矩阵,,,,生物基因(> = 0.27.1),S4VECTORS(> = 0.21.7),iranges(> = 2.17.3),生物比较
进口 统计,矩阵
链接 S4VECTORS
建议 矩阵,,,,HDF5Array,,,,GeneFilter,,,,总结性特征,,,,呼吸道,,,,普里尔,,,,延迟的matrixstats,,,,尼特,,,,生物使用,,,,运行
系统要求
增强
URL
取决于我 延迟Dataframe,,,,延迟的matrixstats,,,,GDSARRAY,,,,HDF5Array,,,,安息,,,,Rhdf5client,,,,Singlecelltk,,,,总结性特征,,,,vcfarray
进口我 Batchelor,,,,beachmat,,,,生物兴奋,,,,BSSEQ,,,,卡格,,,,Celaref,,,,Chippeakanno,,,,簇发酵,,,,DESCAN2,,,,DSS,,,,埃尔默,,,,Genogam,,,,Hipathia,,,,loomexpermiment,,,,mbkmeans,,,,Minfi,,,,NetSmooth,,,,rtcgatoolbox,,,,评分,,,,Scmeth,,,,斯克兰
建议我 Gwascat,,,,我明白,,,,S4VECTORS
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 delayedArray_0.10.0.tar.gz
Windows二进制 delayedArray_0.10.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) delayedArray_0.10.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/delayedarray
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/delayerdarray
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/delayedarray/
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