位深蓝

DOI:10.18129 / B9.bioc.DeepBlueR

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见位深蓝．

位深蓝

Bioconductor版本:3.9

通过R访问深蓝表观遗传学数据服务器。

作者:Felipe Albrecht, Markus List

维护者:Felipe Albrecht < Felipe。albrecht at mpi-inf.mpg.de>， Markus List < Markus。在wzw.tum.de>上列出

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“位深蓝”)

超文本标记语言	R脚本	深蓝表观基因组数据服务器- R包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释，CpGIsland，DNAMethylation，DataImport，DataRepresentation，表观遗传学，GeneRegulation，GenomeAnnotation，ImmunoOncology，预处理，软件，ThirdPartyClient
版本	1.10.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(3年)
许可证	GPL (> = 2.0)
取决于	R (>= 3.3)，XML，RCurl
进口	GenomicRanges，data.table，stringr，diffr，dplyr、方法、rjson跑龙套,R.utils，foreach，withr，rtracklayer，GenomeInfoDb，设置，filehash
链接
建议	knitr，rmarkdown，萝拉，Gviz，gplots，ggplot2，tidyr，RColorBrewer，matrixStats
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	DeepBlueR_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	DeepBlueR_1.10.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	DeepBlueR_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DeepBlueR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DeepBlueR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DeepBlueR/
软件包下载报告	下载数据