该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅Drimseq。
生物导体版本:3.9
该软件包提供了两个框架。一种用于不同条件与TUQTL分析之间的差分转录用法分析。两者都是基于建模与迪里奇 - 单胞分布的基因组特征(即转录本)的计数。该软件包还提供了可视化和探索数据和结果的功能。
作者:Malgorzata Nowicka [AUT,CRE]
维护者:malgorzata nowicka
引用(从r内,输入引用(“ Drimseq”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ drimseq”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
BrowseVignettes(“ Drimseq”)
R脚本 | 用DRIMSEQ软件包在RNA-Seq中进行差异笔录的使用和转录用法QTL分析 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 替代方案,,,,差异性,,,,差速器,,,,基因表达,,,,遗传学,,,,免疫学,,,,多重组合,,,,rnaseq,,,,SNP,,,,测序,,,,软件,,,,工作流程 |
版本 | 1.12.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.3(R-3.3)(3。5年) |
执照 | GPL(> = 3) |
要看 | R(> = 3.4.0) |
进口 | UTIT,统计,大量的,,,,基因组机,,,,iranges,,,,S4VECTORS,,,,生物基因, 方法,生物比较,,,,林玛,,,,EDGER,,,,GGPLOT2,,,,RESHAPE2 |
链接 | |
建议 | pasillatranscriptexpr,,,,geuvadistranscriptexpr, 网格,生物使用,,,,尼特,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | rnaseqdtu |
进口我 | 土匪,,,,同工型间分析仪 |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | drimseq_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | drimseq_1.12.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | drimseq_1.12.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/drimseq |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/drimseq |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/drimseq/ |
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