dmchmm
doi：10.18129/b9.bioc.dmchmm
该包适用于生物导体的3.9版；对于稳定的最新版本，请参阅dmchmm。
使用隐藏的马尔可夫模型对甲基化的CpG进行差异化的CpG
生物导体版本：3.9
在亚硫酸盐测序数据中使用隐藏的Markov模型鉴定差异甲基化的CpG位点的管道。
作者：Farhad Shokoohi
维护者：farhad shokoohi
引用（从r内，输入引用（“ dmchmm”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ dmchmm”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ dmchmm”）
| html | R脚本 | dmchmm |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 覆盖范围，，，，差甲基化，，，，HiddenMarkovModel，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.6.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.6（R-3.4）（2年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | r（> = 3.5.0），总结性特征， 方法，S4VECTORS，，，，生物比较，，，，基因组机，，，，iranges，，，，fdrtool |
| 进口 | UTIT，统计，Grdevices，rtracklayer，，，，多comp，，，，校准，图形 |
| 链接 | |
| 建议 | 测试，，，，尼特 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/shokoohi/dmchmm/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | dmchmm_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | dmchmm_1.6.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | dmchmm_1.6.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dmchmm |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/dmchmm |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/dmchmm/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
