DEQMS
doi：10.18129/b9.bioc.deqms
该包适用于生物导体的3.9版；对于稳定的最新版本，请参阅DEQMS。
对定量蛋白质组学数据进行差异蛋白表达进行统计分析的工具。
生物导体版本：3.9
DEQM在Limma的顶部开发。但是，Limma假定所有基因的先验方差。在蛋白质组学中，蛋白质丰度估计的准确性随无标签和标记数据中量化的肽/PSM的数量而变化。通过多种肽或PSM的蛋白质定量更准确。DEQMS软件包能够估计通过不同数量的PSMS/肽量化的蛋白质的不同先前方差，因此可以提高准确性。该软件包可用于分析无标签和标记的蛋白质组学数据。
作者：Yafeng Zhu
维护者：yafeng zhu
引用（从r内，输入引用（“ DEQMS”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ deqms”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ DEQMS”）
| html | R脚本 | DEQMS R MARKDOWN VIGNETTES |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 贝叶斯，，，，差异性，，，，免疫学，，，，质谱，，，，多重组合，，，，正常化，，，，预处理，，，，蛋白质组学，，，，软件 |
| 版本 | 1.2.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.8（R-3.5）（1年） |
| 执照 | LGPL |
| 要看 | R（> = 3.5），图形，统计，GGPLOT2，，，，林玛（> = 3.34） |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，plyr，，，，矩阵，，，，RESHAPE2，，，，农场，utils，Ggrepel，，，，实验室，，，，LSD |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/yafeng/deqms/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | deqms_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | deqms_1.2.0.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | deqms_1.2.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/deqms |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/deqms |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/deqms/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
