解读

DOI:10.18129 / B9.bioc.DECIPHER

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅解读。

工具进行管理、分析和操纵生物序列

Bioconductor版本:3.9

一个工具集用于解密和管理生物序列。

作者:埃里克·赖特

维修工:埃里克·赖特在pitt.edu < eswright >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“破译”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“破译”)

PDF	R脚本	序列进行分类
PDF	R脚本	设计类属特异性的鱼类探测器
PDF	R脚本	设计类属特异性的引物
PDF	R脚本	设计微阵列探针
PDF	R脚本	设计引物,收益率与签名
PDF	R脚本	发现嵌合序列
PDF	R脚本	开始破解
PDF	R脚本	多重序列比对R的艺术
PDF		参考手册

细节

biocViews	对齐,聚类,DataImport,遗传学,ImmunoOncology,微阵列,微生物组,质量控制,测序,软件,可视化,WholeGenome,qPCR
版本	2.12.0
Bioconductor自	BioC 2.9 (r - 2.14)(8年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.3.0),Biostrings(> = 2.35.12),RSQLite(> = 1.1),统计、并行
进口	方法,DBI,S4Vectors,IRanges,XVector
链接	Biostrings,S4Vectors,IRanges,XVector
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	AssessORF
进口我	AssessORFData,metagenomeFeatures,openPrimeR
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	DECIPHER_2.12.0.tar.gz
Windows二进制	DECIPHER_2.12.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	DECIPHER_2.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DECIPHER
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/破译
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DECIPHER/
包下载报告	下载数据