dbchip

doi:10.18129/b9.bioc.dbchip

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅dbchip

转录因子与ChIP-Seq的差异结合

生物导体版本:3.9

DBCHIP在多个条件下检测到差异结合的尖锐结合位点,无论有无匹配的对照样品。

作者:Kun Liang

维护者:kun liang

引用(从r内,输入引用(“ dbchip”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ dbchip”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ dbchip”)

PDF R脚本 dbchip
PDF 参考手册

细节

生物浏览 chipseq,,,,遗传学,,,,测序,,,,软件,,,,转录
版本 1.28.0
在生物导体中 Bioc 2.11(R-2.15)(7年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 2.15.0),EDGER,,,,deseq
进口
链接
建议 Shortread,,,,生物基因
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我 metagene,,,,metagene2
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 dbchip_1.28.0.tar.gz
Windows二进制 dbchip_1.28.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) dbchip_1.28.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dbchip
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/dbchip
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/dbchip/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网