CoverageView

DOI:10.18129 / B9.bioc.CoverageView

此包适用于Bioconductor的3.9版本;有关稳定的最新发布版本，请参见CoverageView．

R

Bioconductor版本:3.9

该软件包为基因组覆盖概况的可视化提供了一个框架。它可以用于ChIP-seq实验，但它也可以用于全基因组核小体定位实验或其他重要的实验类型，有一个框架，以检查覆盖率如何分布在整个基因组

作者:埃内斯托·罗伊

维护人员:Ernesto Lowy

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“CoverageView”)

PDF	R脚本	易于可视化的读覆盖率
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPSeq，ImmunoOncology，RNASeq，测序，软件，技术，可视化
版本	1.22.0
在Bioconductor公司	BioC 2.14 (R-3.1)(5.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 2.10)，方法，Rsamtools(> = 1.19.17),rtracklayer
进口	S4Vectors(> = 0.7.21),IRanges(> = 2.3.23),GenomicRanges，GenomicAlignments平行，工具
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	CoverageView_1.22.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	CoverageView_1.22.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/CoverageView
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CoverageView
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CoverageView/
软件包下载报告	下载数据