CompGO

DOI:10.18129 / B9.bioc.CompGO

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅CompGO。

R管道请全部文件注释,比较词浓缩之间基因集和数据可视化

Bioconductor版本:3.9

这个包包含函数来完成一些任务。它可以下载完整的从UCSC基因组数据库,导入请全部文件,标注这些轮回文件区域的基因从上述数据库转储(加上距离),界面与大卫创建功能注释和基因本体浓缩图表基于基因列表(比如从输入生成请全部文件)最后想象和比较这些充实使用有向无环图或散点图。

作者:山姆·d·巴塞特(aut),阿什利·j·Waardenberg (aut (cre)

维护人员:阿什利·j . Waardenberg <。在victorchang.edu.au Waardenberg >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“CompGO”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“CompGO”)

PDF	R脚本	介绍
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	去,GeneSetEnrichment,MultipleComparison,软件,可视化
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 2.14 (r - 3.1)(5.5年)
许可证	GPL-2
取决于	RDAVIDWebService
进口	rtracklayer,Rgraphviz,ggplot2,GenomicFeatures,TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene,pcaMethods,reshape2,pathview
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	CompGO_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	CompGO_1.20.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	CompGO_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CompGO
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CompGO
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CompGO/
包下载报告	下载数据