这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅别致的。
Bioconductor版本:3.9
质量控制(QC)管道ChIP-seq数据使用一组全面的质量控制指标,包括此前提出的指标以及小说的,基于局部特征的浓缩。包提供函数来计算一组质量控制指标,与参考价值和机器学习纲要样品质量评价模型。
作者:卡门·玛丽亚Livi
维护人员:卡门·玛丽亚Livi <卡门。在ifom.eu livi >
从内部引用(R,回车引用(“时髦”)
):
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“别致”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“时髦”)
R脚本 | 别致的 | |
参考手册 |
biocViews | ChIPSeq,质量控制,软件 |
版本 | 1.4.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.7 (r - 3.5)(1.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | 仕达屋优先计划R (> = 3.5) |
进口 | ChIC.data(> = 1.3.3),caTools、方法、GenomicRanges,IRanges平行,进步,脱字符号,统计grDevices跑龙套、图形S4Vectors,BiocGenerics |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
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取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | ChIC_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | ChIC_1.4.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ChIC |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/别致 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ChIC/ |
包下载报告 | 下载数据 |