别致的

DOI:10.18129 / B9.bioc.ChIC

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅别致的

质量控制管道ChIP-Seq数据

Bioconductor版本:3.9

质量控制(QC)管道ChIP-seq数据使用一组全面的质量控制指标,包括此前提出的指标以及小说的,基于局部特征的浓缩。包提供函数来计算一组质量控制指标,与参考价值和机器学习纲要样品质量评价模型。

作者:卡门·玛丽亚Livi

维护人员:卡门·玛丽亚Livi <卡门。在ifom.eu livi >

从内部引用(R,回车引用(“时髦”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“别致”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“时髦”)

PDF R脚本 别致的
PDF 参考手册

细节

biocViews ChIPSeq,质量控制,软件
版本 1.4.0
Bioconductor自 BioC 3.7 (r - 3.5)(1.5年)
许可证 GPL-2
取决于 仕达屋优先计划R (> = 3.5)
进口 ChIC.data(> = 1.3.3),caTools、方法、GenomicRanges,IRanges平行,进步,脱字符号,统计grDevices跑龙套、图形S4Vectors,BiocGenerics
链接
建议
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进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 ChIC_1.4.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) ChIC_1.4.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ChIC
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/别致
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ChIC/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网