CellMapper

DOI:10.18129 / B9.bioc.CellMapper

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见CellMapper

预测特定细胞类型中选择性表达的基因

Bioconductor版本:3.9

基于与已知细胞类型标记基因的共表达相似性推断细胞类型特异性表达。可以使用公开的表达数据进行准确的预测,即使以前没有分离过细胞类型。

作者:Brad Nelms

维护者:Brad Nelms 上搜索

引文(从R内,输入引用(“CellMapper”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("CellMapper")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“CellMapper”)

PDF R脚本 CellMapper装饰图案
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneExpression微阵列软件
版本 1.10.0
在Bioconductor BioC 3.4 (R-3.3)(3年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 S4Vectors、方法
进口 统计,跑龙套
链接
建议 CellMapperDataBiobaseHumanAffyData所有BiocStyleExperimentHub
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 CellMapperData
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 CellMapper_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 CellMapper_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) CellMapper_1.10.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CellMapper
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CellMapper
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/CellMapper/
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