CancerSubtypes

DOI:10.18129 / B9.bioc.CancerSubtypes

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见CancerSubtypes．

基于多个基因组数据集的癌症亚型识别、验证和可视化

Bioconductor版本:3.9

CancerSubtypes整合了目前常见的癌症亚型识别计算生物学方法，并提供了基于多组学数据(如基因表达、miRNA表达、DNA甲基化等)的癌症亚型分析的标准化框架。

作者:徐桃生<桃生。X在gmail.com>，Thuc Le

维护者:徐桃生<桃生。X在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("CancerSubtypes")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“CancerSubtypes”)

超文本标记语言	R脚本	CancerSubtypes
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类，GeneExpression，软件，可视化
版本	1.10.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(3年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 3.4)，sigclust，NMF
进口	SNFtool，iCluster，集群，嫁祸于，limma，ConsensusClusterPlusgrDevices,生存
链接
建议	BiocGenerics，RUnit，knitr，RTCGA.mRNA，RTCGA.clinical
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/taoshengxu/CancerSubtypes
BugReports	https://github.com/taoshengxu/CancerSubtypes/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	CancerSubtypes_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	CancerSubtypes_1.10.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	CancerSubtypes_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CancerSubtypes
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CancerSubtypes
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CancerSubtypes/
软件包下载报告	下载数据