CancerMutationAnalysis

DOI:10.18129 / B9.bioc.CancerMutationAnalysis

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见CancerMutationAnalysis．

癌症突变分析

Bioconductor版本:3.9

该软件包实现了癌症体细胞突变研究的基因和基因集水平分析方法。基因水平的方法区分驱动基因(在肿瘤发生中起积极作用)和乘客基因(在肿瘤样本中突变，但在肿瘤发生中没有作用)，并纳入两阶段研究设计。基因集方法实现了一种面向患者的方法，该方法为每个样本计算基因集得分，然后在整个样本中组合它们;还提供了使用Wilcoxon检验的基因导向方法进行比较。

作者:乔瓦尼·帕尔玛吉亚尼，西米娜·m·博卡

维护者:Simina M. Boca

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("CancerMutationAnalysis")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“CancerMutationAnalysis”)

PDF	R脚本	CancerMutationAnalysisTutorial
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	遗传学，软件
版本	1.26.0
在Bioconductor	BioC 2.10 (R-2.15)(7.5年)
许可证	GPL(>= 2) +文件许可
取决于	R (>= 2.10.0)，qvalue
进口	AnnotationDbi，limma、方法、统计
链接
建议	KEGG.db
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	CancerMutationAnalysis_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	CancerMutationAnalysis_1.26.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	CancerMutationAnalysis_1.26.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CancerMutationAnalysis
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CancerMutationAnalysis
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CancerMutationAnalysis/
软件包下载报告	下载数据