该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅cnpbayes。
生物导体版本:3.9
用于批处理效果和拷贝数的贝叶斯分层混合模型。
作者:Stephen Cristiano,Jacob Carey和Rob Scharpf
维护者:jacob Carey
引用(从r内,输入引用(“ cnpbayes”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ cnpbayes”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ cnpbayes”)
R脚本 | 实施贝叶斯混合模型以进行拷贝数估计 | |
R脚本 | CNPBAYES软件包的概述 | |
R脚本 | CNPBAYES软件包的概述 | |
参考手册 |
生物浏览 | 贝叶斯,,,,库务,,,,软件 |
版本 | 1.13.5 |
在生物导体中 | Bioc 3.2(R-3.2)(4年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 3.4.0),iranges,,,,基因组机 |
进口 | RCPP(> = 0.12.1),S4VECTORS,,,,矩阵,,,,rcolorbrewer,,,,gtools,,,,组合,,,,GenomeInfodB(> = 1.11.6),方法,生物基因,图形,统计信息,结尾,,,,总结性特征,,,,mclust,,,,RESHAPE2,,,,GGPLOT2,,,,马格里特,,,,purrr,,,,花花公子,,,,dplyr,,,,蒂布尔,,,,秤,,,,Data.Table,,,,rcpparmadillo |
链接 | RCPP |
建议 | 测试,,,,尼特,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,生物检查,,,,大量的,,,,香草,,,,平淡无奇 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/scristia/cnpbayes |
BugReports | https://github.com/scristia/cnpbayes/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | cnpbayes_1.13.5.tar.gz |
Windows二进制 | cnpbayes_1.13.5.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | cnpbayes_1.13.5.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cnpbayes |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/cnpbayes |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/cnpbayes/ |
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