生物相投

DOI:10.18129 / B9.bioc.BiocParallel

此套餐适用于Biocumonds 3.9版;对于稳定的最新版本版本,请参阅生物相投

Bioconductor设施并行评估

生物导体版本:3.9

此包提供了用于并行评估的修改版本和新颖实现,用于与生物导体对象一起使用。

作者:Biocumond Package维护者[Cre],Martin Morgan [Aut],Valerie Obenchain [Aut],Michel Lang [Aut],Ryan Thompson [Aut],Nitesh Turaga [Aut]

维护者:Bioconductor Package维护者

引文(从R内,输入引文(“生物共同”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“3.6”)并输入:

if(!procenameSpace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager :: install(“Biocomallels”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“BIOCPARILLELS”)

PDF. r script. 1.介绍BiocParallel
PDF. r script. 2. Batchtoolsparam简介
PDF. r script. 3.错误,日志和调试
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

biocViews 基础设施软件
版本 1.18.1
在生物导体中以来 BIOC 2.13(R-3.0)(6年)
执照 GPL-2 |GPL-3
依靠 方法
进口 统计数据,Util,徒劳。霍尔格, 平行,
链接到 BH.
建议 生物根系, 工具,Foreach.Batchjobs.BBMISC.多达齐全RMPI.Genomicranges.rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14.txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene.VariantAnnotation.RSAMTOOLS.基因管理缩短codetools运行生物焦knBatchtools.data.table.
系统要求 C ++ 11.
加强
URL. https://github.com/bioconductor/biocomallal.
Bugreports. https://github.com/bioconductor/biocomparlallel/issues.
取决于我 培根清楚红衣主教classifyr.Clusterseq.共识文案Cydar.迪科delayedarrayDexseq.DMCHMM.DOPPELGANGR.基因组夫妇HireadsProcessor.检查事情Mbased.比赛Metagene2.Oriposope.探险者PCAN.ProMoC.rnaseqgene.rqc.测序缩短sigcheck.Strome4.摘要博马克SVA.xcms
进口我 ABSEQR.粘贴aldex2.扩增人asics.atsnp.匪徒batchelor.贝诺Biocneighbors.生物主学生物贴眼BIOMMBionetstat.生物墨呢bsseqCageFightr.篮球选手Camthc.Cellbaser.蜂窝状cellmixs.chipexoqual.chipqc.ChromSchitch.Chromvar.cnvranger.Cogaps.共识contCOSEQ.cpvsnp.Crispseek.Crisprvariants.CSAW.dcgsa.decomplexdisease.delayedmatrixstats安德斯德内捷德descan2.deseq2.Desingle.困惑DMRSEQ.剂量DRIMSeqDropletuls.easyrnaseq.emdomic.erma.ERSSAFGSEA.findmyfriends.FlowCatchr.gdcrnatools.genogam.基因管理GenotyPeeval.GMAPR.GSEABENCHMARMARLGUIDESEQ.H5VChiccompare.htseqgenie.htsfilter.IASVA.冰茶理想的ihwpaper.IMAS.拖累2.inpas.兴趣电离IPOIVAS.JunctionSeq.kinswingr.线程普利loci2path.洛卡马宏伟麦克巴斯特Metabomxtr.METHYLAID.methylGSA甲基术Methyvim.METNET.MIGSAMinfi.MotifBreakr.mpranalyze.msnbase.多种审核nbamseq.nbsplice.omicslonda.oveseg.锥形PBASE.Powerexplorer.摇篮PrecisionTrialDrawer.挑战profflewlactiple.QDNASEQ.QPGraph..QSEA.Quasr.RCWL.叙事重新rjmcmcncnucosomes.RSAMTOOLS.Ruvcorr.撒尿SCDD.SCDE.骗子斯通得分invhap.screcover.颈背芝麻sigfeature.斯嘉西尔斯文Soggi.Spectraltad.泼溅拼接照片Srnadiff.tarseqqc.TFBStools.tmixclust.特纳时髦的TsrchitectTVTB.txreginfra.variancepartition.变型滤波器Varianttools.Zinbwave.
建议我 CageWorkflow.嵌合体腌制胶癌HDF5Array.methylaiddata.netsmoothomicsprint.purrcistarget.SEQARRAY.SimpleSingleCell.Systempiper.tenxbraindata.tenxpbmcdata.tfutils.TOFSIMS.uposencymotif
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包 biocparallel_1.18.1.tar.gz.
Windows二进制文件 biocparallel_1.18.1.zip.(32-&64位)
Mac OS x 10.11(El Capitan) biocparallel_1.18.1.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/biocomallel
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondudard.org:包装/生物共争
包短网址 https://biocumon.org/packages/biocomparlellal/
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