BiocCheck

DOI:10.18129 / B9.bioc.BiocCheck

此包适用于Bioconductor的3.9版;有关稳定的、最新的发布版本，请参见BiocCheck。

Bioconductor-specific包检查

Bioconductor版本:3.9

执行生物导体专用包检查。

作者:Bioconductor Package Maintainer [aut, cre]， Lori Shepherd [ctb]， Daniel von Twisk [ctb]， Kevin Rue [ctb]

Maintainer: Bioconductor Package Maintainer < Maintainer at Bioconductor。org>

安装

要安装此包，请启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace(“BiocManager”，quiet = TRUE)) install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“BiocCheck”)

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“BiocCheck”)

超文本标记语言	R脚本	BiocCheck:确保Bioconductor包指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	基础设施,软件
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 2.14 (R-3.1)(5.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5.0)
进口	biocViews(> = 1.33.7),BiocManager,stringdist,图,httr、工具、optparse,codetools、方法、跑龙套knitr
链接
建议	RUnit,BiocGenerics,Biobase,RJSONIO,rmarkdown,devtools(> = 1.4.1),usethis,BiocStyle
SystemRequirements
增强了	codetoolsBioC
URL	https://github.com/Bioconductor/BiocCheck/issues
取决于我
进口我	ExperimentHubData
建议我	CNPBayes,curatedMetagenomicData,HMP16SData,SpectralTAD
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	BiocCheck_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	BiocCheck_1.20.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	BiocCheck_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocCheck
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BiocCheck
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BiocCheck/
包下载报告	下载数据