这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见BioNetStat.
Bioconductor版本:3.9
一个包执行差分网络分析,差分节点分析(差分共表达分析),网络和代谢途径视图。参考论文可在https://doi.org/10.3389/fgene.2019.00594上找到。
作者:Vinícius Jardim, Suzana Santos, André Fujita, Marcos Buckeridge
维护者:Vinicius Jardim
引文(从R内,输入引用(“BioNetStat”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("BioNetStat")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“BioNetStat”)
超文本标记语言 | 1.行命令教程 | |
超文本标记语言 | 2.接口教程 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,GeneExpression,GeneSetEnrichment,GraphAndNetwork,ImmunoOncology,代谢组学,微阵列,网络,NetworkInference,通路,蛋白质组学,RNASeq,测序,软件,SystemsBiology |
版本 | 3 |
在Bioconductor | BioC 3.7 (R-3.5)(1.5年) |
许可证 | GPL (>= 3) |
取决于 | R (>= 3.5),闪亮的,igraph,shinyBS,pathview |
进口 | BiocParallel,RJSONIO,晶须,yaml,pheatmap,ggplot2,plyr, utils,统计,RColorBrewer,Hmisc,心理,knitr |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://github.com/jardimViniciusC/BioNetStat |
BugReports | http://github.com/jardimViniciusC/BioNetStat/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | BioNetStat_1.4.3.tar.gz |
Windows二进制 | BioNetStat_1.4.3.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | BioNetStat_1.4.3.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BioNetStat |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BioNetStat |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/BioNetStat/ |
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