BioNetStat

DOI:10.18129 / B9.bioc.BioNetStat

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见BioNetStat

生物网络分析

Bioconductor版本:3.9

一个包执行差分网络分析,差分节点分析(差分共表达分析),网络和代谢途径视图。参考论文可在https://doi.org/10.3389/fgene.2019.00594上找到。

作者:Vinícius Jardim, Suzana Santos, André Fujita, Marcos Buckeridge

维护者:Vinicius Jardim

引文(从R内,输入引用(“BioNetStat”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("BioNetStat")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“BioNetStat”)

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文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpressionGeneExpressionGeneSetEnrichmentGraphAndNetworkImmunoOncology代谢组学微阵列网络NetworkInference通路蛋白质组学RNASeq测序软件SystemsBiology
版本 3
在Bioconductor BioC 3.7 (R-3.5)(1.5年)
许可证 GPL (>= 3)
取决于 R (>= 3.5),闪亮的igraphshinyBSpathview
进口 BiocParallelRJSONIO晶须yamlpheatmapggplot2plyr, utils,统计,RColorBrewerHmisc心理knitr
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建议
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增强了
URL http://github.com/jardimViniciusC/BioNetStat
BugReports http://github.com/jardimViniciusC/BioNetStat/issues
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 BioNetStat_1.4.3.tar.gz
Windows二进制 BioNetStat_1.4.3.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) BioNetStat_1.4.3.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BioNetStat
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BioNetStat
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/BioNetStat/
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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网