此包适用于Bioconductor的3.9版本;有关稳定的最新发布版本,请参见BioCor.
Bioconductor版本:3.9
根据KEGG和REACTOME或基因集中描述的途径计算功能相似度。这些相似性可以计算路径或基因集、基因或集群,并与其他相似性相结合。它们可以用来改善网络、基因选择、测试关系……
作者:Lluís Revilla Sancho [aut, cre], Pau Sancho-Bru [ths]
,胡安José Salvatella Lozano [ths]
维护者:Lluís Revilla Sancho
引用(从R中,输入引用(“BioCor”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("BioCor")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“BioCor”)
超文本标记语言 | R脚本 | 关于BioCor |
超文本标记语言 | R脚本 | BioCor的高级用法 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | 聚类,GeneExpression,网络,NetworkEnrichment,通路,软件,StatisticalMethod,SystemsBiology |
版本 | 1.8.1 |
在Bioconductor公司 | BioC 3.5 (R-3.4)(2.5年) |
许可证 | MIT +文件许可证 |
取决于 | R (>= 3.4.0) |
进口 | BiocParallel,矩阵,GSEABase |
链接 | |
建议 | reactome.db,org.Hs.eg.db,WGCNA、方法、GOSemSim,testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle,气道,DESeq2,引导,targetscan.Hs.eg.db,Hmisc,拼写 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/llrs/BioCor/ |
BugReports | https://github.com/llrs/BioCor/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
给我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | BioCor_1.8.1.tar.gz |
Windows二进制 | BioCor_1.8.1.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | BioCor_1.8.1.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/BioCor |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BioCor |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/BioCor/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |