BioCor

DOI:10.18129 / B9.bioc.BioCor

此包适用于Bioconductor的3.9版本;有关稳定的最新发布版本，请参见BioCor．

功能相似

Bioconductor版本:3.9

根据KEGG和REACTOME或基因集中描述的途径计算功能相似度。这些相似性可以计算路径或基因集、基因或集群，并与其他相似性相结合。它们可以用来改善网络、基因选择、测试关系……

作者:Lluís Revilla Sancho [aut, cre]， Pau Sancho-Bru [ths]，胡安José Salvatella Lozano [ths]

维护者:Lluís Revilla Sancho

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("BioCor")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“BioCor”)

超文本标记语言	R脚本	关于BioCor
超文本标记语言	R脚本	BioCor的高级用法
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	聚类，GeneExpression，网络，NetworkEnrichment，通路，软件，StatisticalMethod，SystemsBiology
版本	1.8.1
在Bioconductor公司	BioC 3.5 (R-3.4)(2.5年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.4.0)
进口	BiocParallel，矩阵，GSEABase
链接
建议	reactome.db，org.Hs.eg.db，WGCNA、方法、GOSemSim，testthat，knitr，rmarkdown，BiocStyle，气道，DESeq2，引导，targetscan.Hs.eg.db，Hmisc，拼写
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/llrs/BioCor/
BugReports	https://github.com/llrs/BioCor/issues
全靠我
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	BioCor_1.8.1.tar.gz
Windows二进制	BioCor_1.8.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	BioCor_1.8.1.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/BioCor
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BioCor
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BioCor/
软件包下载报告	下载数据