BasicStarrseq

doi：10.18129/b9.bioc.basicstarrseq

该包适用于生物导体的3.9版；对于稳定的最新版本，请参阅BasicStarrseq。

基本的峰值呼叫starr-seq数据

生物导体版本：3.9

基于starr-seq数据的基本峰值基于“全基因组定量增强子活性图”中引入的方法，由Starr-Seq鉴定的Arnold等人。科学。2013年3月1日; 339（6123）：1074-7。doi：10.1126/科学。1232542. EPUB 2013 JAN 17。

作者：Annika Buerger

维护者：ukmuenster.de>的Annika Buerger

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ basicstarrseq”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

BrowseVignettes（“ BasicStarrseq”）

PDF	R脚本	BasicStarrseq.pdf
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	覆盖范围，，，，功能基因组学，，，，功能性预测，，，，结肠管制，，，，峰值探测，，，，软件
版本	1.12.0
在生物导体中	Bioc 3.3（R-3.3）（3。5年）
执照	LGPL-3
要看	基因组机，，，，基因组签名
进口	S4VECTORS， 方法，iranges，，，，GenomeInfodB，统计
链接
建议	尼特
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	BASICSTARRSEQ_1.12.0.TAR.GZ
Windows二进制	BASICSTARRSEQ_1.12.0.ZIP
Mac OS X 10.11（El Capitan）	BASICSTARRSEQ_1.12.0.TGZ
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/basicstarrseq
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/basicstarrseq
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/basicstarrseq/
软件包下载报告	下载统计