这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见BaseSpaceR.
Bioconductor版本:3.9
丰富的R接口到Illumina的BaseSpace云计算环境,支持快速开发数据分析和可视化工具。
作者:Adrian Alexa
维护者:Jared O'Connell
引文(从R内,输入引用(“BaseSpaceR”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("BaseSpaceR")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“BaseSpaceR”)
R脚本 | BaseSpaceR | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ConnectTools,DataImport,DataRepresentation,遗传学,HighThroughputSequencing,基础设施,测序,软件 |
版本 | 1.28.0 |
在Bioconductor | BioC 2.12 (R-3.0)(6.5年) |
许可证 | Apache License 2.0 |
取决于 | R (>= 2.15.0),RCurl,RJSONIO |
进口 | 方法 |
链接 | |
建议 | RUnit,IRanges,Rsamtools |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | BaseSpaceR_1.28.0.tar.gz |
Windows二进制 | BaseSpaceR_1.28.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | BaseSpaceR_1.28.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BaseSpaceR |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BaseSpaceR |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/BaseSpaceR/ |
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