BaseSpaceR

DOI:10.18129 / B9.bioc.BaseSpaceR

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见BaseSpaceR

R SDK for BaseSpace RESTful API

Bioconductor版本:3.9

丰富的R接口到Illumina的BaseSpace云计算环境,支持快速开发数据分析和可视化工具。

作者:Adrian Alexa

维护者:Jared O'Connell

引文(从R内,输入引用(“BaseSpaceR”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("BaseSpaceR")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“BaseSpaceR”)

PDF R脚本 BaseSpaceR
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ConnectToolsDataImportDataRepresentation遗传学HighThroughputSequencing基础设施测序软件
版本 1.28.0
在Bioconductor BioC 2.12 (R-3.0)(6.5年)
许可证 Apache License 2.0
取决于 R (>= 2.15.0),RCurlRJSONIO
进口 方法
链接
建议 RUnitIRangesRsamtools
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 BaseSpaceR_1.28.0.tar.gz
Windows二进制 BaseSpaceR_1.28.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) BaseSpaceR_1.28.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BaseSpaceR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BaseSpaceR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/BaseSpaceR/
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Bioconductor

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网