BEARscc

DOI:10.18129 / B9.bioc.BEARscc

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BEARscc。

BEARscc(贝叶斯ERCC Assesstment单细胞集群)的鲁棒性

Bioconductor版本:3.9

BEARscc是一个噪声估计和喷射工具,旨在评估假定的单细胞RNA-seq集群实验噪声估计的上下文中ERCC激增的控制。

作者:大卫·t·Severson < david_severson hms.harvard.edu >

维护人员:本杰明Schuster-Boeckler <本杰明。在ludwig.ox.ac.uk schuster-boeckler >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BEARscc”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“BEARscc”)

PDF	R脚本	装饰图案的标题
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类,ImmunoOncology,SingleCell,软件,转录组
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	ggplot2,SingleCellExperiment,data.table统计,跑龙套,图形,编译器
链接
建议	testthat,cowplot,knitr,rmarkdown,BiocStyle,NMF
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	BEARscc_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	BEARscc_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	BEARscc_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BEARscc
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BEARscc
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BEARscc/
包下载报告	下载数据