ArrayExpress

DOI:10.18129 / B9.bioc.ArrayExpress

此包适用于Bioconductor的3.9版本;有关稳定的最新发布版本，请参见ArrayExpress。

在EBI访问ArrayExpress微阵列数据库并构建Bioconductor数据结构:ExpressionSet, AffyBatch, NChannelSet

Bioconductor版本:3.9

访问EBI的ArrayExpress库并构建Bioconductor数据结构:ExpressionSet, AffyBatch, NChannelSet

作者:奥黛丽·考夫曼，易卜拉欣·埃玛，迈克尔·舒伯特

维护人员:Suhaib Mohammed < Suhaib at ebi.ac.uk>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("ArrayExpress")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“ArrayExpress”)

PDF	R脚本	ArrayExpress:将ArrayExpress数据集导入并转换为R对象
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport，微阵列，OneChannel，软件，TwoChannel
版本	1.44.0
在Bioconductor公司	BioC 2.3 (R-2.8)(11年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 2.9.0)，Biobase(> =测试盒框)
进口	XML，益生元，limma
链接
建议	affy
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	DrugVsDisease，maEndToEnd
进口我
建议我	gCMAPWeb，Hiiragi2013
给我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	ArrayExpress_1.44.0.tar.gz
Windows二进制	ArrayExpress_1.44.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	ArrayExpress_1.44.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/ArrayExpress
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ArrayExpress
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ArrayExpress/
软件包下载报告	下载数据