伴侣

doi:10.18129/b9.bioc.affyrnadegradation

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅伴侣

由于RNA降解,分析和纠正微阵列数据中的探针位置偏差

生物导体版本:3.9

该软件包有助于评估和校正Affymetrix 3'表达阵列中RNA降解效应。参数d给出了RNA完整性的强大而准确的度量。校正消除了探针位置偏差,从而提高了受RNA降解影响的样品的可比性。

作者:Mario Fasold

维护者:Mario Fasold

引用(从r内,输入引用(“递送”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ affrnadegradation”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ affrnadegradation”)

PDF R脚本 递送示例
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 基因表达,,,,微阵列,,,,Onechannel,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,软件
版本 1.30.0
在生物导体中 Bioc 2.10(R-2.15)(7。5年)
执照 GPL-2
依靠 R(> = 2.9.0),方法,副词
进口
链接
建议 ampaffyexample
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 affrnadegradation_1.30.0.tar.gz
Windows二进制 affrnadegradation_1.30.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) affrnadegradation_1.30.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affyrnadegradation
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/递观
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/affyrnadegradation/
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