AffyExpress

DOI:10.18129 / B9.bioc.AffyExpress

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅AffyExpress。

Affymetrix质量评估和分析工具

Bioconductor版本:3.9

这个计划的目的是提供一个全面和易于使用的工具质量评估和识别差异表达基因Affymetrix基因表达数据。

作者:吴Xiwei < xwu coh.org >, Xuejun阿瑟·李在coh.org < xueli >

维护人员:李Xuejun亚瑟< xueli coh.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“AffyExpress”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“AffyExpress”)

PDF	R脚本	1。底漆
PDF		参考手册

细节

biocViews	注释,DifferentialExpression,微阵列,OneChannel,预处理,质量控制,ReportWriting,软件,可视化
版本	1.50.0
Bioconductor自	BioC 2.1 (r - 2.6)(12年)
许可证	LGPL
取决于	R (> = 2.10),affy(> = 1.23.4),limma
进口
链接
建议	simpleaffy,R2HTML,affyPLM,hgu95av2cdf,hgu95av2,test3cdf,genefilter,雌激素,annaffy,gcrma
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	AffyExpress_1.50.0.tar.gz
Windows二进制	AffyExpress_1.50.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	AffyExpress_1.50.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AffyExpress
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ AffyExpress
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/AffyExpress/
包下载报告	下载数据