分配
DOI:10.18129 / B9.bioc.ASSIGN
这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见分配．
自适应签名选择与集成(ASSIGN)
Bioconductor版本:3.9
ASSIGN是一种计算工具，用于评估个体患者样本中的通路解除管制/激活状态。ASSIGN采用了一种灵活的贝叶斯因子分析方法，该方法适应从基于知识的文献或从扰动实验中获得的预定通路签名到细胞/组织特异性通路签名。每个上下文特定通路的解除管制/激活水平被量化为分数，这表示患者样本包含通路解除管制/激活签名的程度。
作者:沈莹，安德里亚·h·比尔德，w·埃文·约翰逊，穆特赫娜·拉赫曼
维护者:沈莹
引文(从R内，输入引用(“转让”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“转让”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 底漆 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | 贝叶斯，GeneExpression，通路，软件 |
| 版本 | 1.20.1 |
| 在Bioconductor | BioC 2.14 (R-3.1)(5.5年) |
| 许可证 | MIT +文件许可 |
| 取决于 | R (>= 3.4) |
| 进口 | gplots，图形，grDevices，二甲基砜，Rlab统计数据,股东价值分析跑龙套,ggplot2，yaml |
| 链接 | |
| 建议 | testthat，BiocStyle，lintr，knitr，rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://compbiomed.github.io/ASSIGN/ |
| BugReports | https://github.com/compbiomed/ASSIGN/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | ASSIGN_1.20.1.tar.gz |
| Windows二进制 | ASSIGN_1.20.1.zip |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | ASSIGN_1.20.1.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ASSIGN |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ASSIGN |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ASSIGN/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
