liftOver

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅liftOver。

改变基因组与rtracklayer坐标系统::liftOver

Bioconductor版本:3.8

liftOver设施结合UCSC的浏览器开发的轨道基础设施可供农庄格式的数据转换。这是说明一个图像的EBI / NHGRI GWAS目录,截至2017年5月10日,分布式的坐标定义为NCBI hg38建造。

作者:Bioconductor包维护者(aut (cre)

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“liftOver”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“liftOver”)

HTML

R脚本

改变基因组与rtracklayer坐标系统::liftOver

细节

biocViews	BasicWorkflow,工作流
版本	1.4.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.3.0),gwascat,GenomicRanges,rtracklayer,Homo.sapiens,BiocGenerics
进口
链接
建议	knitr,rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	//www.anjoumacpherson.com/help/workflows/liftOver/
取决于我
进口我
建议我
我的链接

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	liftOver_1.4.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/liftOver
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ liftOver
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/liftOver/
包下载报告	下载数据