msd16s

DOI:10.18129 / B9.bioc.msd16s

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见msd16s．

健康中重度腹泻16S表达数据

Bioconductor版本:3.8

来自992例健康和中至重度腹泻样本的肠道16S测序表达数据用于“低收入国家幼儿腹泻导致肠道微生物群组成的大规模改变”。

作者:Joseph N. Paulson, Hector Corrada Bravo, Mihai Pop

维护者:Joseph N. Paulson

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("msd16s")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“msd16s”)

PDF	R脚本	msd16s
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentData，MicrobiomeData，SequencingData
版本	1.2.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 2.10)，Biobase，metagenomeSeq
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.cbcb.umd.edu/research/projects/GEMS-pathogen-discovery
全靠我
进口我
建议我	metavizr
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	msd16s_1.2.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/msd16s
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/msd16s
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/msd16s/
软件包下载报告	下载数据