这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见minionSummaryData.
Bioconductor版本:3.8
总结了Ashton等人2015年发表的伤寒沙门氏菌MinION测序数据。三个复制运行分别作为Fast5Summary对象提供。
作者:Mike Smith [aut, cre]
维护者:Mike Smith
引文(从R内,输入引用(“minionSummaryData”)
):
要安装这个包,启动R (version "3.5")并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("minionSummaryData")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“minionSummaryData”)
超文本标记语言 | R脚本 | 创建示例MinION摘要数据集 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | ExperimentData,SequencingData |
版本 | 1.12.0 |
许可证 | MIT +文件许可 |
取决于 | R (>= 3.2.0) |
进口 | |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | 电离 |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | minionSummaryData_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/minionSummaryData |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/minionSummaryData |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/minionSummaryData/ |
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