Leebamviews

doi:10.18129/b9.bioc.leebamviews

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅Leebamviews

Leebamviews-摘自Lee 2009的多个酵母RNASEQ样品

生物导体版本:3.8

PMID 19096707的数据;用于管理多个NGS样品的原型

作者:vj Carey

维护者:vj Carey

引用(从r内,输入引用(“ Leebamviews”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ leebamviews”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Leebamviews”)

PDF R脚本 用BAMVIEW管理多个NGS样品
PDF 参考手册

细节

生物浏览 实验数据,,,,rnaseqdata,,,,SNPDATA,,,,saccharomyces_cerevisiae_data,,,,序列数据
版本 1.18.0
执照 艺术2.0
要看 r(> = 2.15.0),生物酶,,,,rsamtools(> = 0.1.50),BSGENOME
进口 基因组机,,,,基因组签名, 方法
链接
建议 基因组,,,,Biomart,,,,org.sc.sgd.db,,,,EDGER
系统要求
增强 多核
URL
取决于我
进口我
建议我 EDASEQ
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 leebamviews_1.18.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(El Capitan)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/leebamviews
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/leebamviews
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/leebamviews/
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