chipenrich.data

doi:10.18129/b9.bioc.chipenrich.data

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅chipenrich.data

Chipenrich的伴侣包

生物导体版本:3.8

支持Chipenrich软件包的数据。包括预定义的基因集,基因基因座定义和可视性估计值。

作者:Ryan P. Welch [AUT,CPH],Chee Lee [AUT],Raymond G. Cavalcante [Aut,Cre],Laura J. Scott [THS],Maureen A. Sartor [THS]

维护者:Raymond G. Cavalcante

引用(从r内,输入引用(“ chipenrich.data”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ chipenrich.data”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ chipenrich.data”)

html R脚本 chipenrich.data
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 chipseq,,,,表观遗传学,,,,实验数据,,,,功能基因组学,,,,基因烯,,,,历史化,,,,回归
版本 2.6.0
执照 GPL-3
要看 R(> = 3.4.0)
进口 AnnotationDbi,,,,生物基因, 方法,基因组机,,,,GenomeInfodB,,,,iranges,,,,readr,,,,rtracklayer,,,,S4VECTORS,UTILS
链接
建议 生物使用,,,,DevTools,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,roxygen2,,,,测试,,,,go.db,,,,org.dm.eg.db,,,,org.dr.eg.db,,,,org.hs.eg.db,,,,org.mm.eg.db,,,,org.rn.eg.db,,,,txdb.dmelanogaster.ucsc.dm3.ensgene,,,,txdb.dmelanogaster.ucsc.dm6.ensgene,,,,txdb.drerio.ucsc.danrer10.refgene,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown,,,,txdb.mmusculus.ucsc.mm9,,,,txdb.mmusculus.ucsc.mm10.nowngene,,,,txdb.rnorvegicus.ucsc.rn4.ensgene,,,,txdb.rnorvegicus.ucsc.rn5.refgene,,,,txdb.rnorvegicus.ucsc.rn6.refgene
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我 Chipenrich
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 chipenrich.data_2.6.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(El Capitan)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chipenrich.data
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/chipenrich.data
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/chipenrich.data/
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