该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅chipenrich.data。
生物导体版本:3.8
支持Chipenrich软件包的数据。包括预定义的基因集,基因基因座定义和可视性估计值。
作者:Ryan P. Welch [AUT,CPH],Chee Lee [AUT],Raymond G. Cavalcante [Aut,Cre],Laura J. Scott [THS],Maureen A. Sartor [THS]
维护者:Raymond G. Cavalcante
引用(从r内,输入引用(“ chipenrich.data”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ chipenrich.data”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ chipenrich.data”)
html | R脚本 | chipenrich.data |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | chipseq,,,,表观遗传学,,,,实验数据,,,,功能基因组学,,,,基因烯,,,,历史化,,,,回归 |
版本 | 2.6.0 |
执照 | GPL-3 |
要看 | R(> = 3.4.0) |
进口 | AnnotationDbi,,,,生物基因, 方法,基因组机,,,,GenomeInfodB,,,,iranges,,,,readr,,,,rtracklayer,,,,S4VECTORS,UTILS |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,DevTools,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,roxygen2,,,,测试,,,,go.db,,,,org.dm.eg.db,,,,org.dr.eg.db,,,,org.hs.eg.db,,,,org.mm.eg.db,,,,org.rn.eg.db,,,,txdb.dmelanogaster.ucsc.dm3.ensgene,,,,txdb.dmelanogaster.ucsc.dm6.ensgene,,,,txdb.drerio.ucsc.danrer10.refgene,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown,,,,txdb.mmusculus.ucsc.mm9,,,,txdb.mmusculus.ucsc.mm10.nowngene,,,,txdb.rnorvegicus.ucsc.rn4.ensgene,,,,txdb.rnorvegicus.ucsc.rn5.refgene,,,,txdb.rnorvegicus.ucsc.rn6.refgene |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | Chipenrich |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | chipenrich.data_2.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chipenrich.data |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/chipenrich.data |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/chipenrich.data/ |
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