SomaticCancerAlterations

DOI:10.18129 / B9.bioc.SomaticCancerAlterations

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SomaticCancerAlterations。

体细胞癌改变

Bioconductor版本:3.8

体细胞癌症改变数据集的集合

作者:朱利安格林(海德堡EMBL的)

维护人员:朱利安格林< jg-bioc gmx.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SomaticCancerAlterations”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“SomaticCancerAlterations”)

HTML	R脚本	SomaticCancerAlterations - HTML
PDF		参考手册

细节

biocViews	CancerData,ExperimentData,基因组,NCI,Project1000genomes
版本	1.18.0
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.0.0)
进口	GenomicRanges,exomeCopy,stringr,IRanges,S4Vectors
链接
建议	testthat,ggbio,ggplot2,knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	SomaticSignatures
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	SomaticCancerAlterations_1.18.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SomaticCancerAlterations
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SomaticCancerAlterations
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SomaticCancerAlterations/
包下载报告	下载数据