single.mtec.transcriptomes

doi:10.18129/b9.bioc.single.mtec.transcriptomes

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅single.mtec.transcriptomes

单细胞转录组数据和小鼠MTEC细胞的分析

生物导体版本:3.8

该数据包包含用于分析单细胞RNA-seq的代码和来自手稿的大量ATAC-SEQ数据,标题为:单细胞转录组分析揭示了髓质胸腺上皮细胞中协调的异位 - 基因表达模式。本文发表在《自然免疫学》 16,933-941(2015)中。此软件包中提供的数据对象已进行了预处理:可以从登录标识符E-MTAB-3346和E-MTAB-3624下载原始数据文件。此数据包的小插图提供了一个记录的且可重复的工作流程,其中包括用于生成每个统计量的代码和手稿中的数字。

作者:亚历杭德罗·雷耶斯

维护者:Alejandro Reyes

引用(从r内,输入引用(“ single.mtec.transcriptomes”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ single.mtec.transcriptomes”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

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browsevignettes(“ single.mtec.transcriptomes”)

PDF R脚本 分析单细胞MTEC数据。
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细节

生物浏览 实验数据
版本 1.10.0
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源包 single.mtec.transcriptomes_1.10.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(El Capitan)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/single.mtec.transcriptomes
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/single.mtec.transcriptomes
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/single.mtec.transcriptomes/
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