这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见AshkenazimSonChr21.
Bioconductor版本:3.8
SonVariantsChr21是来自Complete Genomics全基因组测序的注释基因组变体数据集。数据来自GIAB项目,Ashkenazim Trio,样本HG002运行1。提供了vcf和注释数据帧。
作者:Tomasz Stokowy
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引文(从R内,输入引用(“AshkenazimSonChr21”)
):
要安装这个包,启动R (version "3.5")并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("AshkenazimSonChr21")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“AshkenazimSonChr21”)
R脚本 | RareVariantVis | |
参考手册 |
biocViews | ExperimentData,GenomicVariation,测序,WholeGenome |
版本 | 1.12.0 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | |
进口 | |
链接 | |
建议 | knitr,VariantAnnotation |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | AshkenazimSonChr21_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AshkenazimSonChr21 |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/AshkenazimSonChr21 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/AshkenazimSonChr21/ |
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